Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zbed4Q80WQ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zbed4Q80WQ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zbed4Q80WQ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zbed4Q80WQ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms