Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms