Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap1Q80TE0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap1Q80TE0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms