Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sgo2Q7TSY8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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