Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dsg1bQ7TSF1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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