Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms