Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn4bQ7M729 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn4bQ7M729 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn4bQ7M729 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn4bQ7M729 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn4bQ7M729 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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