Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox11Q7M6Y2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox11Q7M6Y2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms