Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snd1Q78PY7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snd1Q78PY7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms