Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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