Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms