Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Topbp1Q6ZQF0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Topbp1Q6ZQF0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms