Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp34Q6ZQ93 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms