Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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