Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ino80Q6ZPV2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ino80Q6ZPV2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms