Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR1

Cfap97, Cilia- and flagella-associated protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap97Q6ZPR1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap97Q6ZPR1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap97Q6ZPR1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms