Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms