Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt3Q6PE13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt3Q6PE13 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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