Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cachd1Q6PDJ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cachd1Q6PDJ1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cachd1Q6PDJ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cachd1Q6PDJ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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