Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SvoplQ6PDF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms