Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HltfQ6PCN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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