Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc4Q6PAV2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms