Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms