Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgb4Q6P8W9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms