Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl3Q6P1Y1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms