Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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