Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms