Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms