Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca2Q6DIC0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms