Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbf1Q6DFZ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms