Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms