Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pram1Q6BCL1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pram1Q6BCL1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms