Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms