Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms