Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q66JV7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q66JV7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q66JV7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q66JV7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q66JV7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q66JV7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q66JV7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms