Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top2bQ64511 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms