Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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