Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tfdp2Q64163 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tfdp2Q64163 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tfdp2Q64163 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tfdp2Q64163 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfdp2Q64163 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Tfdp2Q64163 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tfdp2Q64163 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tfdp2Q64163 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tfdp2Q64163 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfdp2Q64163 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms