Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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