Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lcn3Q62471 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lcn3Q62471 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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