Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcncQ62447 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms