Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms