Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sall3Q62255 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Sall3Q62255 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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