Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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