Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms