Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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