Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssr4Q62186 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssr4Q62186 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssr4Q62186 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms