Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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