Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin1Q61644 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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