Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms